昆明市工商行政管理局下辖14个县（市）区工商行政管理局、5个市局派出机构、98个基层工商所 (分局)。昆明市工商行政管理局机关有办公室、法规处、企业注册监督管理处（个体私营经济监督管理处）、外商投资企业注册处、市场规范管理处（网络市场监督管理处）、消费者权益保护处（食品流通监督管理处）、反不正当竞争执法处（直销监督管理处）、广告监督管理处、商标监督管理处、网络信息管理处、计划财务处、基本建设管理处、人事处、监察室14个内设机构和经济检查支队1个直属机构，单设机关党委和离退休人员办公室。另有消费者协会、个体私营经济协会、广告协会、12315申诉举报中心四个事业单位接受工商局管理。